############################################################################### ## NEWS to package RFLPtools ############################################################################### ########################################################### ## Version 1.5 ########################################################### - update of vignette - extension of function RFLPdist2: additional option that missing bands occur only below a specified LOD - new function RFLPcombine to combine RFLP datasets - new function RFLPlod to remove bands below a given limit LOD - more flexible arguments for functions RFLPplot and RFLPrefplot ########################################################### ## Version 1.4 ########################################################### - correction of some minor bugs - added function linCombDist to compute a linear combination of distances - introduced vignettes folder - updated affiliations in vignette and added some explanations regarding the use of NCBI BLAST - added option "sep" to function "read.blast". ########################################################### ## Version 1.3 ########################################################### - added function diffDist for distance matrix computation based on successive differences ########################################################### ## Version 1.2 ########################################################### - RFLPplot and RFLPrefplot gained argument "colBands" to specify color(s) for the plotted bands. - added reference to recent article - in examples now use of simPlot instead of corPlot, hence requires package MKmisc version 0.8 ########################################################### ## Version 1.1 ########################################################### - added NEWS file - some examples simplyfied to reduce check-time - added warnings for BLAST datasets for the case that there are subject.ids which do not occur as query.ids - extended vignette and package Rd-file by RFLPplot and RFLPrefplot examples ########################################################### ## Version 1.0 ########################################################### - start of implementation, first version on CRAN