############################################################################################ kaps 0.9-8 - Add shortcut algorithm to reduce computational cost in kaps(). - Change the output of the apss S4 class. #show() - Change the plot devide for the apss S4 class #plot() ############################################################################################ kaps 0.9-5 - Fixed an error that did not treat a vector in predict(). ############################################################################################ kaps 0.9-4 - Bug fixed. ############################################################################################ kaps 0.9-3 - Modify print function for kaps(). ############################################################################################ kaps 0.9-2 - Treat the example of cost-complexity pruning as an annotation to reduce computing cost in the check process. ############################################################################################ kaps 0.9-1 - Bug fixed. ############################################################################################ kaps 0.9-0 - Add cost-complexity pruning for lrtree (log-rank based recursive partitioning for survival data) - Fix some typos in manuals ############################################################################################ kaps 0.8.3 - Fixed a bug in print.Rd ############################################################################################ kaps 0.8.2 - Improve the example of kaps ############################################################################################ kaps 0.8.0 - Publish kaps algorithm via CRAN ############################################################################################ kaps 0.7.6 - Update show() with approx. p-value in CV ############################################################################################ kaps 0.7.5 - Fix the bug in summary.tree() ############################################################################################ kaps 0.7.2 - Delete apss() in the NAMESPACE. the function apss() serves as a internal for kaps() - Change the treat type for minor parameters in kaps() - Change the name of group argrument as K in order to harmonize the articel and programs ############################################################################################ kaps 0.7.1 - Fix some bugs in the print structures ############################################################################################ kaps 0.7.0 - Publish the beta version of the kaps algorithm via CRAN ############################################################################################ kaps 0.6.7 - Update the package structures ############################################################################################ kaps 0.6.6 - Improve vectorized caculation on group.sel() ############################################################################################ kaps 0.6.5 - Delete maxstat option - Improve parallel computing by using foreach package, (also delete dependence on parallel package) ############################################################################################ kaps 0.6.4 - Improve show.apss plot to print more information ############################################################################################ kaps 0.6.3 - Delete panelty model to find optimal K - Add elbow plot to advice optimal K ############################################################################################ kaps 0.6.2 - Bug fixed on the function, gr.sel, when pre-specified split points worked. ############################################################################################ kaps 0.6.1 - Change the rule to select lambda using overall log-rank statistic (before we use minimum pairwise value). ############################################################################################ kaps 0.6.1 - Add penalized CV model to find optimal K supgroups - Add sample size for each subgroups in summary function - Improve seleting the minimum sample size at each subgroup in order to compare at least 10 subgroups. ############################################################################################ kaps 0.5.2 - Add V-fold cross-validation apss algorithm in order to select more ideal subgroups - Bug fixed in summary ft. ############################################################################################ kaps 0.5.0 - Change the package name rap to kaps (K Adaptive Partitioning for Survival data). - Improve summary function for both apss and Tree classes: including raw data (labeled as Root) summary. ############################################################################################ rap 0.4.3 - Add toy example ############################################################################################ rap 0.4.2 - Bugs fixed when km.curve() runs with various subgroups. - Improve Exhaustive group selecting algorithm. ############################################################################################ rap 0.4.0 - Add adjusted chisquare statistic using the Wilson-Hilferty approximation in order to provide the standard for selecting ideal substaging. - Add new dataset, colon. ############################################################################################ rap 0.3.0 - Bug fixed when lrtree() performed. - Add new stopping rule in order to determine optimal tree size for log-rank tree algorithm. This is based on bootstrapping resampling techniques in split steps. - Add maximally selected rank statistics (splits = "maxstat") in apss-class to provide a variety of split options. ############################################################################################ rap 0.2.0 - Add log-rank tree for censored data (Segal, 1988) as a funciton lrtree() - Change the package name from apss to rap. ############################################################################################ apss 0.1.6 - Add the Wilson-Hilferty approximation statstic to select optimal number of subgroups. - Add the function seer.staging in order to provide WH approximation statistic and permutation test among groups. ############################################################################################ apss 0.1.5 - Improve print information with more interpretable statistic like pairwise statistic and sub options. ############################################################################################ apss 0.1.4 - Add new data, colon, which include the information about colon caner. It is a type of survival data. - Add bootstrap algorithm, apss.boot, to find more optimal split points. ############################################################################################ apss 0.1.2 - Add modified exhaustive search by pre-specified split points and ranges using pre.pt and scope options in apss.control(), respectively. - Add new log-rank test by the rho option in apss.control(). ########################################################################################## apss 0.1.0 - release apss package to provide adaptive partitioning (or staging) for survival data, especially the type of SEER data.